Geber86 / Getty Images
Klíčové jídlo
- Dětská nemocnice v Los Angeles provedla dosud největší pediatrický genomický průzkum COVID-19.
- Studie uvádí možnou souvislost mezi určitými mutacemi SARS-CoV-2 a závažností onemocnění.
- Vzorky vykazovaly v Kalifornii vysokou úroveň genetických variací.
Stejně jako mnoho virů, i SARS-CoV-2, virus, který způsobuje COVID-19, podléhá mnoha genetickým mutacím, protože se šíří velkou populací. Vědci teprve začínají chápat tyto variace a jejich dopad na zdravotní výsledky, zejména u dětí.
V dosud největší pediatrické genomové studii COVID-19 našel tým z dětské nemocnice v Los Angeles souvislost mezi virovými mutacemi a závažností onemocnění. Listopadová studie byla zveřejněna v časopiseOtevřené fórum infekčních nemocí.
"Pokud můžeme udělat cokoli, abychom zjistili, zda existuje nějaká korelace mezi genetikou mutace virového genomu a fenotypem nemoci (pozorovatelné vlastnosti COVID-19), můžete být informováni o tom, jak nejlépe zacházet s pacientem," Xiaowu Gai , PhD, jeden z autorů studie a ředitel bioinformatiky v dětské nemocnici v Los Angeles, říká Verywell.
Ve snaze lépe pochopit, jak může genetická variace ovlivnit pediatrickou populaci, analyzoval výzkumný tým genetickou informaci o viru od 141 infikovaných dětí mezi 13. březnem a 16. červnem. Tyto vzorky vykazovaly vysokou úroveň variací a prevalenci běžné mutace, která je spojena s vyššími přenosovými rychlostmi.
Co to pro vás znamená
Genetický materiál SARS-CoV-2, viru, který způsobuje COVID-19, se neustále vyvíjí. Vědci se snaží pochopit, jak mohou genetické mutace ovlivnit přenos viru a závažnost onemocnění u infikovaných pacientů.
Stále se měnící virus
Mutace jsou chyby, ke kterým dochází v genomu viru - nebo genetickém materiálu - při jeho replikaci. Většina virů zaznamenává určité obměny, když obíhají populaci. V SARS-CoV-2 je mnoho mutací nevýznamných nebo může dokonce oslabit virus. Jiné však mohou ovlivnit, jak snadno se virus přenáší a dokonce i to, jak závažné je onemocnění.
„Když mnoho lidí myslí na COVID-19, myslí na tuto jednu věc, na tuto jedinečnost," říká Gai. „Ale tak se na to nedíváme." Virus v těle pacienta s virovou infekcí je směsicí mnoha různých kopií tohoto viru. “
Jedna běžná mutace, zvaná D614G, způsobuje změny ve špičkovém proteinu viru. I když to nebylo převládající, když se virus začal šířit po celém světě počátkem tohoto roku, verze se od té doby stala celosvětově dominantní. Autoři uvádějí, že byl přítomen v 99,3% pediatrických vzorků, které shromáždili.
Mutace D614G, která zvyšuje špičkový protein používaný virem k získání vstupu do lidských buněk, umožňuje snadnější přenos viru. Dosud neexistují žádné přesvědčivé důkazy o tom, že tato mutace mění závažnost symptomů onemocnění.
Spikovaný protein COVID-19 zprostředkovává vstup koronaviru do hostitelské buňky.
Výzkumný tým však našel souvislost mezi klade 20C - mutovanou verzí viru - a závažnějšími příznaky. Klady 20A, 20B a 20C jsou všechny nedávno zmutované verze viru. Všechny závažné pediatrické případy a všechny, až na jeden středně závažný případ, v této studii měly verzi viru s kladu 20C.
Důsledky mutací
"Když se veřejnost dívá na takové prohlášení, zní to děsivě, že virus mutuje," říká Verywell Stuart Campbell Ray, MD, odborník na infekční nemoci a profesor medicíny na Univerzitě Johna Hopkinse. "Ale všechny RNA viry mají rychlost mutace." A rychlost mutace SARS-CoV-2 je asi pětkrát pomalejší než chřipka - alespoň to bylo doposud. “
Tato relativně pomalá rychlost mutace může být užitečná pro vědce, kteří se snaží zvládnout nový virus. Ray však varuje, že s rostoucí populací infikovaných lidí se bude zvyšovat také rychlost, jakou mutace probíhají.
Se zavedením řešení na podporu imunitního systému proti virové infekci - jako je očkování, předchozí expozice viru, rekonvalescentní plazma a léčba protilátkami - se SARS-CoV-2 může vyvinout, aby se vyhnul imunitní odpovědi. To znamená, že je možné, že kandidáti na vakcíny, kteří jsou v současné době slibní, mohou být v příštích měsících méně efektivní, protože virus bude nadále mutovat.
"Existuje riziko - protože tato pandemie je mimo kontrolu - že by se tyto mutace mohly hromadit a mohly by se vyskytnout ty správné, které by se mohly vyhnout imunitní odpovědi," říká Ray, který není do studie zapojen.
Vakcíny, které se osvědčily, stále pravděpodobně chrání tělo před virem. Ale jak je tomu u jiných rozšířených virů, jako je chřipka, může být nutné použít doplňkové nebo nové verze vakcíny k pokrytí všech nových kmenů viru, které se v budoucnu objeví.
Řešení neznámých proměnných
Ačkoli se uvádí, že COVID-19 je pro děti méně závažný než dospělí, podle studie je na JIP přijato každé třetí dítě hospitalizované pro toto onemocnění. Gai říká, že u pacientů, u nichž došlo k těžkému průběhu onemocnění, porozumění genetickému složení viru by mohlo poskytnout určitý klíčový pohled na vývoj léčby.
Samotný makeup viru může genetikům jen tolik říci o tom, jak ovlivní infikované lidi. Musí také vzít v úvahu demografické a genetické informace infikované osoby.
Gai varuje, že i když tato zjištění mohou naznačovat korelaci mezi určitými mutacemi a jejich výsledky, je stále zapotřebí mnoha větších studií, které by prokázaly, že mutace rozhodně způsobuje závažnější onemocnění. Přestože byl dosud největším genomickým pediatrickým průzkumem COVID-19, zahrnoval pouze 141 dětí.
"To ve skutečnosti není příliš velká velikost vzorku," říká Gai. "Nemůžeme provést korelační analýzu pro každou jednotlivou mutaci s fenotypem choroby."
Studie dále nezohledňovala rozdíly ve věku, pohlaví, již existujících podmínkách a dalších důležitých faktorech. Nálezy týkající se virové zátěže pacientů mohou být také zkresleny podle toho, kdy byly pacientům odebrány vzorky. Studie přesto přispívá k rostoucímu množství znalostí o tom, jak mohou genetické variace ovlivnit důležité zdravotní výsledky.
"Potřebujeme takové zprávy, abychom získali představu o tom, jak se virus vyvíjí," říká Ray. "Sekvence ze studií, jako je tato, ve spojení se sekvencemi z celého světa mají zásadní hodnotu, protože nám pomáhají pochopit, jak se tento virus vyvíjí a zda je třeba upravit naše strategie, abychom jej zvládli."
.jpg)
